針對台北農產公司董座及總經理人事問題，有媒體報導，指牽涉到藍營、前雲林縣長張榮味與綠營的勢力之爭，台北市長柯文哲2日表示，他覺得自己像日俄戰爭中的中國，「兩邊都打我」、「他們決定我也沒意見」。
柯文哲上午是在出席「2016健康物聯網黑克松閉幕式頒獎典禮」會後受訪表示，農產公司最近新的董事會將成立，新的人事由董事會投票選舉，他並沒有預設立場。媒體也詢問，介入農產公司人事，是否因認為農會體系能夠影響中南部選舉，跟未來競選總統有關？柯文哲笑說「你想太早了」，「若是講會影響台北市長選舉還比較像」，「講到總統去，你差不多啦」。
媒體跟著追問，從來沒想過選總統嗎？柯文哲未回應此問題，僅表示，農產公司的人事選舉他夾在藍綠中間很痛苦。
稍早之前媒體曾報導，民進黨與柯文哲要聯手，從藍營手中拿回台北農產運銷公司經營權，代表雲林前縣長張榮味勢力的總經理韓國瑜，將轉任有給職市政顧問，由農委會指派民進黨秘書處主任蔣玉麟出任總經理。但日前又傳出，由柯文哲推派的董事長許長仁提前打包下台，作為韓去職的交換條件，由前司法院長林洋港姪女林秋慧出任新任董事長，為的就是消除張榮味派的反撲。
但當媒體進一步詢問，為何決定由林秋慧出任董事長時，柯文哲又說「這就是三方妥協」，在董事會重組後，董事長就選大家可接受的，總經理他希望還是專業導向，等董事長選出來再去處理即可，他希望農產公司不要像選舉組織，這樣觀感不佳。
