內政部9日宣布，在都委會的審議下，所有委員一致通過台南市鐵路地下化都市計畫變更案。都委會認為，行政院所核定的「南鐵東移」地下化方案，比起自救會提出的「東側臨時軌加原軌地下化」方案，還要少拆119戶民宅，且從正當性、公益性以及必要性來評估，政院「東移」版，均優於自救會版本。
內政部政務次長花敬群在會後強調，南鐵東移案絕非迫遷，有83%被徵購戶在工程完成後，可以遷回原地，且原來的鐵道處將會改建成「路寬40米的公園道」，與過往居住在鐵道一旁不同。
而少部分住戶因為徵購範圍太大，導致沒有剩餘土地，花敬群表示，未來也可用半價申購台南市政府設置在附近的安置住宅，未來台南市新車站也將座落在當地，交通非常便捷。
都委會也表示，在比較行政院核定的「南鐵東移」版本，以及自救會所提原軌地下化方案後，他們認為自救會版本的唯一優點，在於被徵用土地的地主在完工後，可取回原本土地。但此方案與行政院核定案都會有房屋受到拆遷，且自救會版本較政院版多拆119戶，受到衝擊範圍明顯較大。
都委會也表示，鐵路地下化的土地徵收是長條狀，與大區段的區域土地徵收不同，政院「東移」版所徵購的土地面積，多為低於10坪的小面積，且83%被徵購戶可於工程完成後，還可回到原地更新重建家園，其餘17%受到影響面積較大的家戶，也有安置住宅方案，及台南市政府的弱勢家戶照顧方案來保障居住權益，內政部稱，「不會造成任何家戶受到明顯迫害情形。」
