對於中國國台辦稱「涉及兩岸關係根本性質的原則問題，是一道繞不開的必答題，沒有任何模糊的空間。」陸委會25日呼籲，雙方都應放下歷史包袱、敞開心胸，珍惜過去20多年來協商和交流互動成果，繼續秉持相互諒解、求同存異的政治思維，展開良性對話，共同努力維護現有機制，以維護兩岸人民的福祉權益。

陸委會重申，總統蔡英文在就職演說中已明確表達，根據中華民國憲法、兩岸人民關係條例及相關法律，處理兩岸事務；在既有事實及政治基礎上，持續推動兩岸關係和平穩定發展現狀，此一立場非常堅定，同時已展現我方最大的彈性與善意。陸委會認為，雙方都應務實面對並妥善處理兩岸關係，這也是兩岸共同的責任。

對於國台辦發言人馬曉光批評蔡英文提出的「新南向政策」是「為政治目的服務、違反經濟規律的作法，給許多台商的利益造成巨大損害，也給台灣的經濟造成不良影響。」

陸委會指出，蔡英文在就職演說中強調，將積極參與區域事務，加強和區域的連結；未來也將就此和對岸就共同參與區域發展的相關議題，坦誠交換意見，尋求各種合作與協力的可能性，並堅守和平原則，為兩岸及區域的和平穩定與發展，做出貢獻。