針對馬政府在沖之鳥海域與日本發生漁權糾紛，行政院發言人童振源23日表示，沖之鳥究竟是島或是礁，目前是個爭議，新政府會尊重聯合國大陸礁層界限委員會（CLCS）的決定，在未決定之前，「我們不採取法律上的特定立場。」

前總統馬英九在卸任前多次聲明沖之鳥是礁非島，更愛用沖之鳥的面積去衡量所在空間，態度強硬引發日本政府的抗議。據了解，對於這個爭議，新政府的國安高層已拍板，政府立場將尊重聯合國大陸礁層界限委員會的決定。

行政院宣布，有關台、日之間最近所發生的漁業糾紛，台、日雙方經過磋商之後已達成共識，宣布成立台日海洋事務合作對話機制，積極促進各項海洋事務的合作。

至於馬政府任內派遣巡邏船至沖之鳥周邊海域護漁一事，童振源表示，政府態度是「護漁不容許打折扣」，會善盡該有的護漁做法與政策，在沖之鳥礁附近護漁船艦，則會視情況再做調整。台、日雙方也都會克制。