隸屬海巡署洋巡總局的台南艦爆出弊案，2007年陸續公開招標後，終於在2010年交船，但隔了6年卻爆發採購弊案，甲板驗收不符合標準，直升機無法起降，多名承辦人涉嫌收賄、放水驗收，士林地檢署3日指揮新北市市調處到海洋總局北部辦公處所4處、南部6處搜索，並調閱相關卷證，約談數十名現役、退役官員，預計深夜將移送士林地檢複訊。
台南艦驚傳採購弊案，疑似有高官包庇造船業者偷工減料，讓艦艇的甲板停不了直升機。經士林地檢署蒐證後，3日指揮新北市調查處搜索中信造船廠及多名官員住家，並約談11名官商到案，將依《貪污治罪條例》移送士檢複訊。
檢調查出，高雄海洋巡防總局在驗收新型巡防艦「台南艦」甲板工程時，有官員涉嫌明知廠商偷工減料，卻包庇業者通過驗收，導致台南艦無法依原訂造艦計畫在甲板上起降直昇機。
對此，海洋巡防總局已提供當時採購、驗收相關資料，配合檢方調查，而部分承辦人員因事隔久遠，不少人已調離現職，甚至退休的也不在少數，檢方兵分多路，要還原當時事件是否涉弊。
台南艦2000噸級巡防艦，造價15億元，成軍時是海巡署噸位最大的巡防艦，該艦配備68人，每小時15節，負責執行海上緝私、海難救助等任務，並由中信造船廠承造。2007年間公開招標，2010年11月建造完成並交船。
