2016大選落幕，台灣團結聯盟因為僅獲2.5%的政黨票，區域立委更是全軍覆沒。為此，台聯黨主席黃昆輝18日中午發布新聞稿指出，「昆輝領導無方，應負全責，宣布請辭黨主席」。 

黃昆輝表示，台聯黨在此次大選遭受重大挫敗，領導無方，應負全責，因此，宣布請辭黨主席。 

台聯16日晚間曾發布新聞稿指出，面對選舉結果，無法跨過5%政黨票門檻，黨主席黃昆輝對所有支持者表示抱歉，將深切反省、檢討改進，重新出發。18日中午，則進一步傳出黃昆輝請辭的訊息。