立法院臨時會今（13）日起展開，在下午2時召開院會前，先召開程序委員會決定今、明（14）日，以及下週二（18日）3天1次會的議程。不過，爭議性高的「核四公投案」被排入這次院會的第29案，引發民進黨立委田秋堇的不滿，要求應撤掉；但國民黨方面認為，院會的決議無法在程序委員會更改，朝野立委當場在程序委員會上演一陣激辯。最後，經過協商，朝野一致決定將核四公投案，排在這次院會的最後1案。
立法院今日中午召開程序委員會，安排今、明日、下週二3天1次會的議程，其中，由國民黨立委李慶華提出的核四公投案，被排在這次會的第29案，讓田秋堇大表不滿，她說，如果6月臨時會時通過核四公投案，中選會就被迫在1到6個月內舉行公投，但核能專家林宗堯曾說，核四的安全檢測需在明年3月左右才能完成，「為什麼不能等呢」？
田秋堇還說，馬英九、江宜樺都曾說過「沒有核安，就沒有公投」，在此前提下，如急著列入公投案，將違背馬、江的承諾，也違核安最高原則，因此她呼籲暫緩列案。
不過，國民黨中央政策會執行長林鴻池則表示，對於核四公投案，是否贊成見仁見智，但核四存廢問題已吵了20幾年，因此才會交給全民做決定，立法院也須遵從。至於核四核安的問題，林鴻池認為，核安檢測和核四公投是可以並行不悖的，如果核四公投支持續建者為多數，但核安有疑慮「也是推不下去的」。
國民黨立院黨團書記長賴士葆則說，今日上午立法院舉行談話會，已經表決通過將核四公投案列入議程，程委會並沒有翻案的權力；根據相關規定，「關於議程的安排，須透過表決處理」，朝野黨團都已簽字同意這次的議程，程序委員會並沒有權力可以凌駕院會。
台聯立院黨團總召許忠信則認為，今日上午已召開談話會處理臨時會的議案，因此，程委會沒有辦法剔除核四公投案；不過，程委會仍有職權決定議案的先後順序，他建議，將核四公投案列為這次臨時會最後一案。經過協商後，朝野立委決議，將核四公投案列為這次會最後一案，才平息了這場風波。
此外，立法院會今日將優先處理行政院提出的「會計法」第99條之1修正條文覆議案，並於明日邀請行政院長江宜樺到立法院會提出12年國教專案報告、備質詢。而「中央政府總預算案」、《所得稅法》部分條文修正草案、《濕地法》部分條文修正草案，則被列為這次會討論事項前3案，上述法案可望在18日討論。
而林鴻池在程委會後表示，核四公投案將放在臨時會接近尾聲時在處理，不過「絕對不會是最後一案」。
