總統兼國民黨主席馬英九今（22）日表示，台灣漁民的生命安全不能靠別人的善意，要靠自己的實力，未來將常態性的護漁，「哪裡有漁民，哪裡就有海巡」，以保障漁民的權益；雖然菲律賓適用海洋法中的群島海域，在該領域擁有比較高的管轄權，但在國際間絕對禁止開槍射擊人，他強調，有這種情況發生，就構成國家的責任，所以必須由菲政府出面道歉，才能還台灣漁民一個公道，這是態度問題。
國民黨下午舉行中常會，邀請外交部長林永樂就「廣大興28號」案進行專題報告，馬英九在聽取報告後，做了以上表示。
馬英九表示，根據《聯合國海洋法公約》第73條規定，即使在專屬經濟區內執法也只能採取「登臨、檢查、逮捕和進行司法程序」，除此之外，不能有其他暴力行為；但是菲律賓海巡人員船上有15枝自動武器，並槍擊我漁船，光是駕駛艙方圓5公尺之內，就有26個彈孔，因此我方檢察官以蓄意殺人來調查此案。
他說，就算台灣漁船是在菲律賓的領海或群島基線內，國際間也是絕對禁止對人開槍射擊的，因此菲律賓的行為，當然構成國家的責任，我國要求必須由菲國政府出面道歉，因為這不是菲律賓人民與台灣人民之間的問題，而是菲律賓政府與台灣人民之間的問題，所以必須要由菲國政府正式道歉，才能還給漁民公道。至於賠償部分，我們現在並沒有要求賠多少錢，最重要的是態度問題，做錯事情就是要道歉、賠償。
對於我方提出的道歉、懲凶、賠償和進行台菲漁業協議談判等4項要求，馬英九認為，這是最基本的。對於我方調查團前往菲律賓受阻，他也指出，剛開始的時候，是遭受一些小挫折，但現在台、菲雙方已經在進行細部討論，這個案子需要雙方合作，因為凶手、凶槍、凶船在菲律賓，而被害人和受害船隻在台灣，雙方一定要合作，才能解決問題，這是必須要做的，至於怎麼做？法務部已和菲國司法部代表在進行相關研商中，也有部分進展。
馬英九進一步表示，漁業協議談判不見得要和調查綁在一起，基本上，這是針對未來的，避免類似狀況再度發生，因為誠如林永樂所說，過去10年已經發生過22次台菲漁業糾紛。他同時也指示農委會與漁民多溝通，出海捕魚時，一定要在合法範圍內，不要因為誤入他國水域造成誤解，漁民的權益要保障，漁民生命要維護，這是政府的基本態度。
對於連日來有關菲國在台人民受干擾等傳聞，馬英九說，他在第一時間即要求治安單位對於菲律賓在台灣的僑民生活、工作都要適度保障，不要受到傷害或歧視，中華民國是文明國家，不要將菲律賓政府不義的行為，遷怒於菲律賓在中華民國境內的人民。
