2012總統大選日益白熱化，但行政院的公務同樣繁忙，吳敦義身兼國民黨副總統候選人的身分與行政院長之職，如何兼顧？吳敦義今(9)日表示，目前還是以行政院長的工作為主，這是國家賦予、應該做好的職務，只可能利用假日來跑選舉行程，目前尚能負荷，會把持「不利用公家資源」的分際，但未來若覺得時間難以調配，會考慮為拼選舉而請假。

吳敦義下午在行政院大禮堂舉辦就職2周年與媒體茶敘活動，就媒體詢問如何兼顧副總統候選人與行政院長工作時，吳敦義回應指出，他現在絕大多數的時間都運用在公務上，例如南瑪都颱風來襲時，他一定與全體相關同仁嚴陣以待。因此，只能利用假日的一些適當時段，去做一些可能是候選人的工作。他同時表示，但有些活動也屬於公務範圍，是他以行政院長身分受邀參與的。

吳敦義強調，他會抓好分界線，那就是不要用公家資源做為競選資源。但最後，吳敦義也坦承，如果哪一天覺得在時間上難以調配時，還是會考慮請假，但不是現在。