總統府在昨晚指出，前總統陳水扁執政8年的總統府等17個辦公室，收文共3萬8924件，僅2568件歸檔，1萬0958件不知去向，全案送請監察院查辦。民進黨中央及立院黨團在今（30）日大動作反擊，黨發言人林右昌表示，府方收發文件包含賀卡、陳情信等，包羅萬象，此等指控是誤導大眾，非常荒謬。
林右昌說，所有在公務機關工作過的人都知道，不是每件「外收發」登錄的文件都是公文，畢竟「外收發」收到的文件包羅萬象，包括活動邀請、首長私函，甚至聖誕卡、賀年卡，還有陳情信等都在登錄範圍。總統府把「外收發」登錄的數量捏造為「公文」統計數字的分母，甚至控訴「公文」不見，這是非常荒謬的事情。
林右昌強調，如果需要首長批示或歸檔的正式公文，總統府相關承辦局處一定會催辦結案，並循公文程序歸檔，不會發生公文佚失、未歸檔的問題。至於送進首長辦公室的報告，也就是媒體報導所稱的「抄本」，其實都不是正式公文，處理方式就是按過去模式依法閱畢後銷毀，因此也沒有所謂歸檔的問題。
對於總統府惡意抹黑民進黨執政時期的相關首長，林右昌說民進黨要強烈譴責府方離譜的行徑，呼籲總統府不要刻意操弄這些無聊的事情；畢竟專心執政、顧好民生，才是馬總統應該努力去做的工作。
民進黨籍立委一早同步在立院展開反擊，黨團幹事長高志鵬、書記長翁金珠、立委葉宜津、黃偉哲上午召開記者會表示，單純的文件檔案處理，竟在民進黨總統初選時刻變成政治鬥爭的工具，總統府儼然已變總統馬英九競選辦公室，並要求馬團隊的政權移交小組成員要為清點不實出面說明。
