中科三期遭台北高等行政法院裁定暫時停止執行，然而中科園區內的友達及旭能2廠商卻不受影響，引發環保團體質疑環保署執法不公､霸凌司法。行政院環保署今（18）日上午召開記者會，澄清媒體及外界的誤解。環保署強調，已經依法發函令中科管理局停止開發行為，但廠商的使用執照、建照、雜照等不屬於環評法範籌，所以環暑無權要求停工。
環保署綜合計畫處處長葉俊宏表示，外界誤認環保署未依法要求友達、旭能2廠商停工，甚至指責環署上訴動作是「霸凌司法」、「浪費司法資源」，環署認為這些批評都是「有心人士」的刻意操作、混淆大眾視聽。
葉俊宏指出，＜環境影響評估法＞第14條第1項所指開法許可無效，是指未經環評審查的開發行為，然而中科三期的狀況卻是「已經」通過環評審查、並發出開發許可，所以不屬＜環評法＞規範內，而是由＜行政程序法＞去處理，也就是，友達和旭能的停工與否是中科管理局的裁決權，不是環保署的權限。
葉俊宏解釋，最高行政法院2010年判決撤銷中科三期2006年的環評審查結論，理由是認為環評審查對健康風險的評估有瑕疵，所以環署在重新召開健康風險的專家會議後，再次於2010年9月2日作出通過中科三期的開發。他說，中科的健康風險小於百萬分之一，對居民的健康並無長期不利影響之虞。
葉俊宏強調，依法上訴是法律賦予環署的基本權利，不能因為環署依法上訴而誤指「浪費司法資源」、「踐踏司法」。他表示，台北高等行政法院2008年及最高行政法院2010年的判決，都未要求環署要將中科三期進入第2階段環評的程序，所以環署無法認同2月24日的裁定法官認為要進2階的看法，將依法提出上訴程序。
