中颱凡那比為高屏地區帶來的豐沛降雨量遠超出中央氣象局預期，外界認為氣象局雨量修正時間太晚，多名學者與專家對此表示，颱風雨帶重組是關鍵因素，大氣短時間內的變化即便偵測到，也很難預測最大降雨量在哪裡發生。
中央氣象局18日清晨發布凡那比颱風陸上警報後，預測高雄及屏東平地最高雨量都是500毫米，山區是700毫米；19日下午1時及晚上7時，2次修正山區雨量，高雄及屏東分別上修到1200毫米及1400毫米，平地雨量預測在傍晚6時修正1次，高雄上修到1000毫米，屏東上修到700毫米。
結果降雨量超乎預測，高雄平地降雨高達800多毫米，屏東平地也有600多毫米，造成多處淹水，高雄岡山和左營的降雨量，還創下18年來新紀錄。
對於外界質疑氣象局雨量修正時間太慢，台大大氣系教授李清勝認為，雨量預測是全球氣象科技上最困難的問題，凡那比豐厚降雨的主因，除了颱風結構紮實外，19日出海後雨帶又重新組成，提供颱風更多水氣是主因，即使很快發現到雨帶重組現象，也不可能精確知道最大降雨出現的地點。
氣象局預報中心副主任林秀雯認為，大氣結構相當複雜，即使透過先進的雷達和衛星，都只能得到有限的訊息，氣象局做颱風雨量預測時，還會參考電腦模擬、過去類似路徑颱風的雨量平均，並隨著颱風的動態，每3小時做1次檢討，若有突然的變化，也會臨時修正，但強烈降雨提前預知的時間非常有限。
對外界將凡那比與去年的莫拉克相比，氣象局預報中心前主任吳德榮表示，這明明是2個長相不同、發展環境完全不同的颱風，硬將颱風期間數小時雨量相比沒道理。氣象局第1次預測高屏平地有500毫米雨量，就已是淹水警訊，只是科技的發展，只能預測大量降雨會出現在西南部。
