他表示，兩岸政治層次議題不代表是「你死我活」的零合遊戲，雙方要有智慧找到「最大公約數」，兩岸關係才能穩定持續發展。

劉兆玄卸任後，日前首度接受中央通訊社專訪時表示，兩岸問題的本質在於不可能永遠維持在經濟層次，目前雙方雖定位在經濟層次，但中國大陸方面希望漸漸觸及到政治層次的趨勢會愈來愈明顯，雙方互動將會面臨這問題。

劉兆玄指出，台灣當然有準備，而這種準備就需要溝通，包括台灣內部溝通、中國大陸內部溝通及兩岸間的溝通。

他說，兩岸問題的最後結果，不可能停留在只談經濟不談政治，且壓力會愈來愈大，這是必須面對的事，如何找到更宏觀的視野，維持長期和平及互利的兩岸關係是目前最重要的事，總統馬英九對這些事都很清楚。

兩岸經濟合作架構協議 (ECFA)部分，他說，兩岸應可完成簽署，但接下來怎麼做，雙方都應有一些準備與想法，畢竟這些事務都不是哪一個人說了算，台灣內部要與民意及在野黨溝通，中國大陸內部也有不同意見，雙方都要及早因應。