為因應扁案的蒞庭工作，台灣高檢署已指派張進豐、林錦村、黃和村 3位「重案蒞庭小組」的檢察官接手公訴，特偵組也派出檢察官林（吉吉吉）慧、李海龍、周士榆協助蒞庭工作。
高院指出，高院刑事部分目前共有 90名法官，除4人因病或是屆退，可免參與抽籤外，其餘法官都將參與這次扁案抽籤，否則法官必須能提出停分的理由，並獲全體法官會議通過，才得免參與抽籤。
高院表示，基於安全顧慮，未來旁聽扁案與台北地院一樣，民眾必須上網登記抽籤，中籤者才會發放旁聽證；陳水扁在押時也將走特殊通道，不會與一般民眾混雜在一起。
另外，高院所在轄區的台北市警察局中正一分局日前接獲通報，高院可能在23日或24日召開扁案接押庭。為避免挺扁及反扁民眾聚集滋生事端，警方屆時將派出數百警力，維持現場秩序。
