公益彩劵之發行有公益目的，透過民眾購買協助充實政府社會福利資源，以促進社會福利落實。然而，監察院調查發現，多個縣市政府透過調借公益彩券盈餘分配基金或專戶的款項，補貼公庫透支或債務，主管機關財政部卻未能建立督管機制，因此提出糾正案。
監察院調查發現，2012年至2016年間共有8個縣市政府向所設立的公益彩券盈餘分配基金或專戶調借款項，動輒上億元，卻沒有事先提報管理委員會審議。監察院認為，縣市政府的調借核准欠妥當，例如高雄市借調上億金額居然是由社會局局長、甚至副局長直接核准；有3個縣市長期調度鉅額款項，苗栗縣迄今仍有新臺幣6.1億元未償還。另外有12個縣市政府將該基金或專戶納入集中支付，供公庫統一調度使運。
監察院憂慮，地方政府調借或納入集中支付之舉措，會妨礙到獲配公益彩券盈餘運用的效能，此事均攸關社會福利的正常推動及弱勢族群的及時照顧。監察院批評，財政部並沒有相關的查核監督機制，因此，監察院財政及經濟委員會、內政及少數民族委員會聯席會議於5月2日通過調查報告，糾正財政部。
監察院強調，財政部為主管機關，權責是督導考核地方公彩盈餘的歲入預算編列、執行率、管理委員會運作、資訊公開及形象宣導等事項，理應建立相關督考機制，為購買彩券的人民負起監督公益彩券盈餘保管及運用的職責，促請財政部會同衛福部共同檢討改善。
監察委員江綺雯、副院長孫大川表示，自1999年12月開辦起，截至2016年底，公益彩券盈餘挹注全國22個地方政府辦理社會福利的金額累積已達1,932億餘元，已成為地方推動社會福利政府的重要財源。也發現，公益彩券的發行以後，盈餘分配予地方政府的指標，及社福推動的成效，財政部並無設立定期檢討評估機制。
各地方政府都有設立運用管理委員會，負有監督地方公彩盈餘分配款管理及運用的重要任務，但監委調查後發現，部分縣市的委員會組成結構，因為弱勢團體的代表性不足而有欠平衡、委員出席率欠佳、未落實利益廻避，也有多由代理出席之情況等，諸多未能落實公益作為的缺失。財政部坦言，過去確實未注意委員的出席狀況，亦未進行考核，將提改善措施。
