行政院日前公布首屆「促進轉型正義委員會」正、副主委及部分委員提名名單。前監察委員、台灣研究基金會創辦人黃煌雄被提名擔任促轉會主委，但卻遭台大歷史系教授陳翠蓮反對，指黃煌雄消費蔣渭水、利用台灣史，出賣集體尊嚴換取個人官位，這只是她反對黃煌雄擔任促進轉型正義委員會主委的原因之一。
究竟，黃煌雄前些年的言行，為何讓相關人士如此反彈？特別是黃煌雄與馬英九之間的交好事蹟為何？新頭殼整理如下：
黃煌雄任第三屆監察委員(1999-2005) 馬英九擔任台北市長（1998～2006）
黃煌雄卸任監委期間：2006年不同時期不同的蔣渭水論述，黃煌雄卸任監委期間將黨外時期出版《台灣的先知先覺者》，重新出版改為《台灣的孫中山》，謀得監察委員之職，並提供馬英九連結台灣歷史舞台。
2008年3月 馬英九當選總統，黃煌雄公開發表投書〈魔咒已破 鞏固台灣民主〉，分析民進黨敗選為訴諸過去與悲情，而無法訴諸政績，讚許馬英九是國民黨致勝關鍵。
投書寫：「儘管此次總統大選，相對而言，是團結的國民黨對離心的民進黨，但國民黨總統候選人如果不是馬英九，即使國民黨贏了，也不可能像馬英九贏得那麼甜美。長期以來，由於媒體的形塑，在一般社會的觀感中，馬英九建立了清新、不沾鍋的形象，在當前惡質的政治風氣下，這一形象成為他的一大政治資產；加上，近年來他勇於面對台灣歷史記憶的誠意與努力，以及他在此次總統大選中深入基層的行腳與長住，且一再表示要找回台灣傳統核心價值的作法，都使他成為國民黨的『異數』，也使他成為一位真正融入台灣主流社會、並為主流社會所接受的外省人。」
黃煌雄任第四屆監察委員：馬英九擔任總統（2008～2016）
2008年7月 經馬英九總統提名，黃煌雄擔任第四屆監察委員。
2011年11月 馬英九總統競選連任，「馬吳總部《安心手札》文宣中，監委黃煌雄具名推薦馬英九，引發黃煌雄違反行政中立爭議。
黃煌雄具名推崇馬英九：「從市長到總統，馬先生對於蔣渭水的推崇與用心，始終如一，令人感動。」黃煌雄這段話雖是在紀念蔣渭水的場合所說，但馬吳總部副執行長羅智強要用他這段話，曾致電向黃煌雄確認。
2010～2013年 黃煌雄擔任監委期間，以台灣研究基金會名義，招攬台灣學者到北京召開蔣渭水研討會，參訪延安等，相關會議舉辦過多次，直到黃煌雄監委卸任後，北京當局不再補助。近日，台北市長柯文哲已說明他到延安參訪，團長正是黃煌雄。
2014年1月21日 馬英九總統提名新任監委在即，監察院彈劾在馬王政爭中洩密的檢察總長黃世銘，黃煌雄投下反對彈劾黃世銘的關鍵票，導致檢察總長黃世銘洩密彈劾案意外翻盤，依監察法對同案無法再提彈劾，黃世銘確定保住官位。
報載：黃煌雄在前2次審查會都請假避開，第3次審查會出席時，贊成派原以為有黃煌雄「相助」，必能順利彈劾，但傳出黃煌雄在審查會裡，引用中研院院士胡佛在中國時報的文章「光天化日、入人於罪」，將總統也納入「檢察一體」的一環，竟在審查會中極力反對並投下反對票，讓彈劾案意外翻盤。
2014年7月22日 黃煌雄卸任監委前，召開記者會說明調查國民黨黨產案，宣告國民黨黨產案已結案，要求政院列管。黨產案多為民進黨政府期間調查結果，在馬英九總統任內，黃煌雄擔任監委六年期間，對國民黨黨產案並無更廣泛及進一步的實質調查。黃煌雄在國民黨黨產案報告結論，「包括李登輝以來的國民黨歷任黨主席中，馬英九主席算是最勇於面對、且一度展現最有決心來澈底處理黨產的一位，他曾承諾於2008年以前將黨產處理完畢，但現在已是2014年，馬主席的這項承諾仍未兌現。」
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