對於農會選舉敗選所引發的風波，民進黨選對會召集人陳明文1日出席中常會前表示，先前，認為如果因為農會選舉而產生黨內的不和諧，「這是我的責任，所以我應該要辭召集人這個職務。」但是，蔡英文總統認為，這件事情只要講清楚，黨內還是和諧的。既然蔡英文這樣拍版，「我就覺得，這件事情總算是過去了」。
針對農會選舉，新潮流系中常委林宜瑾、沈發惠在民進黨2月22日中常會砲轟，黨內高層先前透過媒體放話，企圖為即將到來的敗選卸責，而把責任推給高雄市長陳菊、台南市長賴清德。蔡英文則於2月27日邀集蘇貞昌在內等黨內各派系領袖聚會，化解爭議。會中，陳明文一度表示，將辭去選對會召集人一職，蔡英文則表示慰留。
對於整個過程，陳明文1日出席中常會前表示，上週中常會有人對於農會改選好像有些意見。事實上，大家都知道農民是民進黨非常堅定的支持者，所以民進黨希望能透過全國農會系統照顧農民。但他們非常清楚，基層農會的藍綠結構，「基本上，藍大於綠是很難撼動」，所以在農會選舉過程，「民進黨沒有推動基層農會的選舉」，但希望在全國農會能夠透過「執政縣市長」跟縣市農會結合，希望能夠要到全國農會代表的席位，進而能爭取更多席次。
陳明文表示，這樣的一個過程，很多人不是很瞭解，所以產生誤會。經過說明後，大家大概都能夠瞭解。
對於蔡英文慰留他續任民進黨選對會召集人，陳明文表示，如果因為農會選舉產生黨內的不和諧，「這是我的責任，所以我應該要辭召集人這個職務」。
陳明文表示，但是總統蔡英文認為，這個事情只要講清楚，黨內還是和諧的。既然總統這樣拍版，「我就覺得這種事情總算是過去了」。
