總統府21日天正式公告《勞基法》新制，並分3階段實施，一例一休將從23日開始施行，放寬勞工特休假及刪除國定7天假日從106年1月1日起實施，輪班制需間隔11小時部分，則待行政院決定實施日期。不過，由於同一部《勞基法》修正案卻區分不同時程上路，且一例一休23日施行後，意謂休假日加班費將調整，許多企業人資抱怨措手不及，但勞動部長郭芳煜22日受訪時強調，「一切都是按照程序進行，從來就沒有提早的問題」。

依據修正進程，立法院通過修法法案後，會送至總統府，總統在收文後10天內必須公告，並且法案在公告3日後開始施行。郭芳煜解釋，關於一例一休的修法進程都是按照正常程序進行，「大家好像都誤以為要等到106年1月1日才開始，擴大所有條文，但是其實不然」。

但媒體追問，若是23日開始施行一例一休後，意謂休假日加班費將以勞動加班費新制為準，「等於12月有兩種不同的加班費算法」，企業雇主抱怨太過麻煩，郭芳煜回應，勞動部網站中有提供試算的系統給企業參考。

郭芳煜更表示，《勞基法》修正通過後，還經過10天總統府處理的過程，企業雇主應該也知道大概何時會開始實施，他建議業者有不清楚的地方，都可上勞動部網站利用試算系統。