台北市長柯文哲上任後成立廉政委員會調查前朝「5大案」，但監察院認為，廉委會在未有法律明文規定下行使調查權，顯有違法，因此，對台北市政府提出糾正。對此，市府發言人林鶴明澄清，廉委會是市府的諮詢單位，是依法成立，且其調查權限與法規也有相關法令明定，並無違誤之處。
針對大巨蛋案，監察院11日通過對北市府糾正案。主要原因有二，其一，監院認為，北市未善盡契約勘驗責任，詳實比對建築圖說與現場差異，且未考量與遠雄具有BOT夥伴關係，透過媒體忽而解約、換手，致使兩造信賴關係破壞殆盡，顯有不當之處。
其次，監院也提到，北市廉委會在未有法律明文規定下行使調查權，其設置法定依據、職掌、人員組成方式與調查權限之範圍，違反正當法律程序原則與司法院釋字585號解釋意旨，「顯有違法」。不過，監院也認為，遠雄公司身為起造人任意修改原核准圖說，邊做邊改，致引發公安疑慮，同樣具有無可迴避的責任。
對此，林鶴明11日下午回應，市府一向善盡BOT甲方的責任，但市府同時也是主管機關，亦依建築法等，負起監督工地、工程管制的責任。因此，去年發現遠雄未按圖施工，而予以勒令停工，就是希望其能依法依約改善。
林鶴明強調，過去監察院也曾對大巨蛋的合約提出39項糾正，柯文哲上任後也相當重視，一直希望遠雄正視此事，但遠雄至今仍不願作出改善。他並重申，市府非常重視工地安全，將會依照監察院調查方向，要求遠雄做好工地安全維護。
至於廉委會部分，林鶴明澄清，廉委會屬於市府諮詢單位，所作的報告僅是參考使用，且其調查權及範圍，皆遵照相關法令規定，不會有踰矩的情事發生。此外，若調查結果涉及司法監察部分，市府也會透過行政程序送司法監察機關調查，並無違誤之處。
媒體詢問，廉委會既已被監院指出「違法」，未來是否可能廢除？林鶴明對此重申，廉委會依法成立，目前並未有此討論，但若有需要可以向監委提出說明。至於廉委會的調查權的法源依據，林鶴明表示，會再要求政風處提出說明。
