對於中研院院長人選問題，據悉，任期只剩9天的總統馬英九10日晚間表示，會與總統當選人蔡英文共商該項人事案，但仍會由他圈選新院長，不會交由新政府決定。

總統府10日批准中研院長翁啟惠辭呈，並由副院長王汎森代理院長至新任院長選出為止，但仍未圈選新院長。

對於新任院長之任命，朝野紛紛表達看法。民進黨發言人楊家俍10日表示，尊重馬英九的職權，但中研院院長人選的圈定是重大人事決定，但馬英九卸任只剩9天，這麼重大事務在倉促間進行恐有失周全，建議馬再商酌。

國民黨立委李彥秀認為，馬英九應該有機會留給下一任總統做決定，相信馬英九會尊重英文的意見；時代力量立委黃國昌則認為應尊重中研院的遴選結果，由蔡英文上任後為之較妥適。

對此，據悉馬英九10日晚間透露，會與蔡英文交換意見，共商新院長人選，但會用電話或會面方式則仍未決定，不過，會由他圈選新的中研院長，不會交由新政府決定。