針對檢調20日大規模搜索中研院長翁啟惠的辦公室與住處，並將翁啟惠列為被告，國民黨21日發表聲明表示，翁啟惠創下中研院院長辦公室首度遭檢調搜索紀錄，更是首位遭列被告的院長，為維護中研院長的聲望與名譽，國民黨建議翁啟惠應「即刻請辭下台」，誠實接受司法調查。

國民黨文傳會21日對發表聲明稿指出，為了捍衛清廉價值是該黨一貫堅持立場，呼籲準總統蔡英文必須為此事表態。文傳會指出，中研院是國家最高學術研究機構，而且翁啟惠具有公務人員身分，如今浩鼎案從內線交易擴大為案外案，如果翁啟惠真的接受企業無償申讓股票，也可能違反貪污治罪條例，不容翁啟惠再次規避各界質疑。

最後，國民黨文傳會呼籲新政府，未來如何兼顧生技產業發展，並且避免類似浩鼎案等諸多複雜政商爭議事件再次重演，才是國人所期待的。