日本熊本縣當地時間16日凌晨1時25分(台灣時間16日0時25分)，再度發生規模7.1強震，震央同樣位於熊本地方，震源深度也是約10公里，屬於淺層地震。

日本氣象廳已對九州有明海及八代海發出海嘯警報。目前尚不清楚地震是否造成傷亡。

熊本縣14日晚間才發生芮氏規模6.5、最大震度7的強震，日本氣象廳當時預測1週內可能出現搖晃強烈的餘震，並預估16日起下雨，呼籲民眾要嚴防土石災害。