文化部次長邱于芸15日在立法院備詢時證實，自己寄了存證信函給部長洪孟啟，但她強調，函中是強調她並未洩密。對此，行政院長毛治國16日認為，「這不是一般做法，也並不適當」，希望事情儘快落幕。法務部長羅瑩雪則指出，該案第1階段的調查16日就會送進政院處理。
毛治國上午至立法院接受總質詢，國民黨立委孫大千問到，媒體大幅報導文化部補助藍委案，此時邱于芸卻又對洪孟啟寄出存證信函，政院和文化部應該如何處理？由於洪孟啟身體不適未出席院會，代理出席的次長陳永豐表示，內部管理會按照《公務員服務法》，就洩密部分積極處理，「很快就會有答案」，也希望同仁遵守法律，嚴守公務保密原則。
毛治國也表示，文化部次長以法律文件表達意見，不是一般的做法，「這種做法事實上也並不適當」，同仁之間還有很多溝通方式，希望事件盡快落幕，讓文化部業務回到正軌。關於外界關切立委補助金案，毛治國則認為，該案已進入調查階段，他不便對個案表示意見，尊重廉政署調查結果。
孫大千強調，要先釐清文化部內是不是真的有補助藍委案？是誰提出來？這些都要查清楚行政單位是否應懲處或負起政治責任，再來，才是洩密跟存證信函的問題，「現在關注洩密是本末倒置、存證信函是枝微末節」。毛治國則再次回應，廉政署會有較全面性的調查，尊重其調查結果。
羅瑩雪則指出，廉政署第1階段針對部分人士約談的調查16日已經送到部內，接下來「馬上會報到院裡」。孫大千則說，希望調查公平、公正、公開，若真的有行政團隊犯錯，「我們絕不手軟」，但行政團隊若沒有犯錯，「也不能蒙受不白之冤」。
