針對反課綱學生日前衝進教育部一事，台北市長柯文哲24日晚間在臉書上發文，對北市警局在執法過程中逮捕3名記者，對侵犯記者採訪自由一事致歉。柯文哲25日下午受訪時，被問到是否會認為逮捕記者行為過當？柯回應，他寧可等到檢討報告交出來後再處理，至於此次是否會懲處中正一分局長張奇文？柯文哲搖頭說「這次不會」。
柯文哲昨晚在臉書上發表4點聲明，除了對侵犯記者採訪自由一事道歉，他也表示北市府也會盡快於近日擬定SOP，以確認中央與地方之權責區分，避免基層員警於執法時陷入為難的情況。
柯文哲下午出席活動受訪時表示，以前非緊急事件都有SOP，但是當天市警局長邱豐光報告說這次是緊急事件，所以他說就重新定義緊急狀況下的SOP，釐清北市府和警政署的權責將來該怎麼處理；媒體問逮捕記者一事會不會執法過當？柯文哲說他寧可等到報告交出來再處理，他也要求邱豐光跟記者團體講清楚，這種事件現場，記者的權利義務要講清楚，凡事不以個案處理、保持中立。
至於中正一分局張奇文的整個執法過程，包括上束帶、沒收手機等事情，柯文哲說所謂「不教而殺謂之虐」，他寧可認為是因為沒有規則可循，沒有講說什麼可以、什麼不可以做。
媒體問張奇文昨日說逮捕學生和記者是自己下令的？柯文哲說他只知道一點，「我沒有下令，所以他後面是誰下令…我就…不知道也不敢揣測」。媒體問是否會懲處張奇文？柯文哲說「這次不會」。
媒體又問這次柯文哲的處理態度怎麼和過去對內湖分局長、信義分局長等事情不太一樣，標準不一？柯文哲說因為這是政治案件、兩極對抗，柯說上次內湖分局長是倒霉，他也已經認錯了，分局長事掃到颱風尾，但這次要拿小的出來扛，「我就幫他扛住」。
另外，警方自24日凌晨起執法後，直到昨晚拖了12個小時柯文哲才發文道歉，媒體問柯文哲的危機處理是否太慢？柯文哲則說這事情也沒那麼嚴重，他也不想讓局長去當替罪羔羊，所以他就扛起來。
