針對日前反課綱學生夜襲教育部一事，教育部決定訴諸法律途徑，對闖進教育部內的學生提告，台北市長柯文哲25下午受訪時表示，他覺得教育部長當然有權利說要告，但是不是說不要用這種方式，這也不是好的教育，他會建議吳思華撤告，接著柯文哲說「不過他(指吳)也是打手啊！也沒辦法」。
柯文哲下午出席2015年亞洲柔道公開賽台北站活動，會後受訪時表示，他認為課綱是意識形態問題，教育部去修改課綱本身就挑起意識形態，而民進黨縣市首長聯名一事，其實他也是滿為難的。他覺得兩極對抗，要保持中立保持的滿辛苦的。
對於昨日在臉書道歉一事，柯文哲再次強調，他的態度不希望說給基層員警去承擔，像過去前中正一分局長方仰寧因為太陽花事件要背40幾個案子，他很反對這樣，所以這次就當作突發事件，因為沒有規則可循，所以他就先扛下來，回過頭去再處理SOP的問題。
至於臉書上對學生聲援，柯文哲說，這就是意識形態問題，他說教育部搞課綱微調本身就充滿政治意味，民進黨的做法也是，他就很為難，不知道怎麼處理；而北市府後來在課綱微調也選了盡量中立的做法，就讓各校各自決定，北市府內的學校也沒有說都用舊的或新的課綱。
至於學生闖進教育部的作法，柯文哲說他也不是很贊成啦，但做事情就是這樣，「像太陽花學運說它對不對？當一個國家不正常的時候，每個人要做正常的事情也不容易」。
媒體追問柯文哲剛剛說吳思華是誰的打手？柯文哲趕緊轉移話題說「好啦、好啦、好啦！我又失言了，不要問我」，不過訪問結束後柯文哲仍然說了句「他也是打手啊，不是嗎？」
