台北市長柯文哲20日上午才表示，針對大巨蛋工程案不排除在這兩天收集資料後，斷然處置勒令停工，北市府晚間立刻發出聲明指出，遠雄集團在大巨蛋工程涉及違反建築法第58條，都發局20日正式發函，以書面勒令遠雄巨蛋公司立即停止施工並即刻提出改善計畫。

北市府指出，據文化局報告資料顯示，自今年2月中旬，松菸古蹟達行動值的監測點數量顯見升高，而捷運局資料也顯示鄰捷運側監測值於3月明顯惡化。但是遠雄在3月27日於北市府內召開的雙方會議中表示，在大底未完成前停工會影響公共安全，因此北市府為維護市民安全，在4月24日成立監督小組進入大巨蛋開挖基地內勘查，並多次要求遠雄提出具體改善計畫、全區大底施工時程，也要求遠雄加速完成大底。

北市府表示，經過持續觀察，捷運板南線監測值近期仍有波動，而松菸古蹟之監測值持續惡化，情況並未改善，顯見遠雄輕忽市民安危及不重視文史古蹟保存。

另外，北市府為保護市民安全及古蹟，5月12日發文要求遠雄應於5月18日之前提出具體改善計畫，但遠雄巨蛋公司5月11日至5月19日共函覆本府7件相關公文，皆未提出具體改善內容。

北市府指出，遠雄應3月19日文資會勘之要求，在5月15日提交本府文化局針對古蹟毀損的修復計畫，內容僅針對松菸修復，完全無涉及工程改善，更隻字未提如何避免加劇影響捷運及破壞古蹟之計畫。北市府批評，諸多行徑皆顯見遠雄態度傲慢、極盡敷衍及輕忽廣大市民生命安全。

北市府表示，遠雄不斷以大底未完成無法停工為由推託，原先承諾7月可完成大底，卻不斷修改時程，5月18日來函改口大底要到8月15日才能完工，一再拖延。北市府為維護市民生命安全，今日正式發函要求遠雄立即停工，並即刻提出具體的大巨蛋工程改善方案，以消除社會疑慮，再行復工。